Zmieniające się okoliczności funkcjonowania systemów logistycznych powodują, że poszukiwane są coraz nowsze metody poprawy skuteczności ich działania. Jedną z dróg, które prowadzą do podniesienia efektywności jest odpowiednie dobranie sposobu kierowania. W logistyce istnieją sektory (np. wojskowość), w których stosuje się kierowanie przez cele, zadania i instruktaże.
Wprowadzanie innowacji w przedsiębiorstwach i innych podmiotach działających w łańcuchu dostaw często utożsamiane jest z wdrażaniem nowych bądź doskonaleniem istniejących produktów. Niemniej jednak w obszarze logistyki innowacje często związane są z technologią, metodą bądź organizacją. W ostatnim stuleciu najbardziej charakterystyczne zmiany, które wyznaczyły kierunki, w jakich podążały przedsiębiorstwa, związane były m.in. z filozofią "Just In Time".
Jednym z istotnych zagadnień analizowanych obecnie w logistyce jest problematyka zarządzania realizacją projektów logistycznych. W ramach niej badane są m.in.: lokalizacja zakładów produkcyjnych, budowa magazynów, wdrożenie systemu WMS, wybór systemu magazynowania, wybór środków transportu, optymalizacja tras przewozu, zmiana operatora logistycznego, zmiana procesów logistycznych, wdrożenie lub rozbudowa systemu IT wspierającego logistykę, wdrożenie lub rozbudowa systemu klasy ERP, wybór nowego dostawcy.
Działalność przedsiębiorstw w warunkach globalizacji wymaga szybkiego podejmowania decyzji dotyczących wiodących kierunków ich rozwoju, a także elastyczne dopasowywanie strategii do zmieniających się szybko warunków rynku.
Zarządzanie kategoriami produktu jest obszarem pod względem systemów logistycznych wyzwaniem badawczym. Poszukiwanie rozwiązań systemowych opiera się na analizie przepływów materiałowych w łańcuchach dostaw, ponieważ to one determinują koordynację i zarządzanie kategorią. Jedną z zasadniczych funkcji logistycznych w zarządzaniu kategoriami jest planowanie logistyczne.
Nieoczekiwane i szybkie zmiany zachodzące w otoczeniu to ogromne wyzwanie dla każdego podmiotu gospodarczego. Zdaniem G. Nizarda naciski wywierane przez środowisko na przedsiębiorstwo przejawiają się w trzech głównych formach.
Koncepcja społecznej odpowiedzialności zyskuje coraz szersze grono zwolenników. Dyskusja na temat tego, czy przedsiębiorstwo może i powinno być społecznie odpowiedzialne, przeradza się w poszukiwanie obszarów tej odpowiedzialności oraz narzędzi i metod, które mogą być wykorzystane, aby połączyć interes przedsiębiorstwa z realizacją celów i roszczeń interesariuszy. Rozpatrywana idea zakorzenia się we wszystkich sektorach i branżach, wśród podmiotów gospodarczych o różnej wielkości.
Jednym z najważniejszych zadań, jakie nakłada się na państwo w kwestiach związanych z zarządzaniem kryzysowym jest zapewnienie bezpieczeństwa dla ludności oraz ich mienia w sytuacjach zagrożenia. Aby sprostać tym wyzwaniom, powołano organa i instytucje wraz z siłami i środkami niezbędnymi do ratowania życia, zdrowia i mienia obywateli - przed skutkami klęsk żywiołowych, katastrof naturalnych lub awarii technicznych.